Prima Serie

Nella prima serie una ragazza terrestre della città di Gardenia, di nome Bloom, scopre di essere in realtà una fata e decide di andare a studiare nella dimensione magica di Magix, nella scuola per fate ad Alfea, seguendo così il consiglio di Stella, una delle studentesse della scuola, incontrata a Gardenia mentre stava combattendo contro Knut, l'orco delle Trix, tre streghe, studentesse di Torrenuvola. Ad Alfea, Bloom, fa la conoscenza di altre tre fate, Musa, Flora e Tecna ed insieme danno vita al gruppo al Winx Club.

Gli episodi di questa serie sono incentrati sulla rivalità che si instaura tra le Winx e le Trix, tre streghe, di nome Icy, Darcy e Stormy, allieve della scuola di Torrenuvola intente ad entrare in possesso del potere della Fiamma del Drago per poter conquistare Magix. In supporto delle Winx entreranno in azione anche i cavalieri, detti specialisti, della scuola di Fonterossa. Tra i singoli componenti degli specialisti e delle Winx nascerà da subito qualcosa di più di una semplice amicizia.

Episodio dopo episodio Bloom prende dimestichezza dei poteri di cui dispone e delle sue reali origini.

Seconda Serie

Nella seconda serie le Winx, sempre supportate dai ragazzi di Fonterossa, dovranno lottare per sventare i piani del malvagio Lord Darkar, il terribile signore delle ombre, il quale, aiutato dalle Trix, vuole conquistare il sommo potere di Magix. A dar loro manforte ci saranno anche Aisha, la bellissima e potentissima fata dei fluidi, la quale entrerà a far parte a pieno titolo del gruppo, e le Pixies, sorta di fatine in miniatura. Tra le ragazze ed alcune pixie si stabilisce un legame molto forte.

Ad Alfea arriverà anche un nuovo insegnante, Avalon ,che si scoprirà essere alleato a Lord Darkar,che cercherà di instaurare un buon rapporto con Bloom,per avere la sua fiducia.

E mentre Darkar cerca di impadronirsi del Remix, suddiviso in quattro parti, I Codex, che sono nascosti nelle Scuole di Magia e nel villaggio delle Pixies, arriverà anche Helia, un ragazzo stupendo che verrà accolto nel gruppo degli Specialisti anche se aveva intenzione di lasciare la scuola;egli s'innamorerà di Flora. Intanto le Winx ottengono gli Charmix. Bloom viene trasformata in Dark Bloom,da Lord Darkar,ma le Winx riusciranno a liberarla ,battere Lord Darkar e salvare Magix!

Terza Serie

Per le sei Winx, ad Alfea, è cominciato il terzo anno di corso, che vede come obbiettivo principale la conquista dell'Enchantix, l'ultimo livello per diventare vere fate,livello ottenibbile solo dopo aver fatto un grosso sacrificio per qualcuno del proprio regno!!

Ma per Bloom ,e le sue amiche, ci saranno ben altri problemi:infatti le Trix risvegliamo Valtor un ,misterioso e, potentissimo mago,molto legato alle origini di Bloom.

Ma a dare man forte contro questo nuovo nemico ,che cerca di impossessarsi nel corso della serie degli svariati regni magici (Phiros , Solaria, Andros, Oppositus etc...) , arriveranno nuove fate da ogni parte dell'Universo Magico e un misterioso apprendista mago di nome Ophir che farà battere il cuore ad Aisha, che si scoprirà essere Nabu, il promesso sposo di Aisha!

Intanto le Winx dopo svariate difficoltà guadagnano l'Enchantix e grazie all'utilizzo dei loro nuovi poteri (la polvere di fata ) e delle Stelle d'Acqua il potere opposto alla fiamma del drago, un privilegio speciale dedicato alle Winx per le quale hanno dovuto affrontare le prove più difficili, riusciranno a salvare Magix ancora una volta dal potentissimo Valtor!

Intanto Bloom ha scoperto cose inimmagginabili sul suo passato e sui suoi genitori , ma non è ancora tutto risolto... come finirà l'avventura delle Winx , è tutto da vedere !